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南宫28分子克隆实验流程与注意事项

来源:褚洁利 日期:2025-03-24

二、TOPO克隆PCR产物的纯化回收

南宫28分子克隆实验流程与注意事项

1. PCR反应完成后,需进行琼脂糖凝胶电泳鉴定,以确认是否存在目标大小的条带。

2. 推荐采用切胶回收的纯化方式,切胶时间尽量控制在3分钟内,以避免紫外线对DNA造成损伤。回收浓度可借助NanoDrop或OneDrop等仪器检测,浓度应≥30ng/μl,并需再次跑胶以确认仅存在目标条带。

3. 将目标片段连接至载体:连接反应体系需按照说明书要求操作,各成分体积应≥1μl;若浓度过高可进行适当稀释。连接反应温度可尝试设定为25°C或37°C,持续时间为5分钟;若克隆不佳或出现空载体/假阳性情况,可尝试延长至30分钟。

4. 感受态转化涂板的准备:选择使用DH5α、Fast-T1等用于克隆的化学感受态细胞。务必注意,感受态细胞不可重复冻融,-80°C冻结后建议一次性使用。

5. 重组产物与感受态细胞的体积比例应为1:10,推荐将10μl重组产物加入至100μl感受态细胞,或5μl重组产物加入至50μl感受态细胞。

6. 热激时间按照感受态细胞说明书进行操作,平板抗生素的抗性需与转化载体的抗性保持一致。

7. 涂板的菌液体积:将菌液离心(2500×g,3分钟),移去多余LB培养基,保留100μl重悬液后全部涂布,或吸取适当体积进行涂板。

单克隆菌落PCR鉴定

1. 挑取平板中大小适中的单克隆菌落,避免选择过大或过小的菌落。

2. 对挑取的多个单克隆菌落进行鉴定分析。

3. 将采集的菌落放入已加入10μl ddH2O的15ml或2ml EP管中,充分溶解混匀后吸取1-2μl作为PCR反应(10/20μl体系)模板。

4. 推荐使用一对分别位于片段和载体的上下游引物进行PCR鉴定。

如模板中存在Amp/kana抗性的质粒,需对目标片段进行切胶回收。

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